Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARHGAP27Q6ZUM4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARHGAP27Q6ZUM4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms