Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF493Q6ZR52 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF493Q6ZR52 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms