Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SHISA2Q6UWI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHISA2Q6UWI4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms