Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZBED9Q6R2W3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZBED9Q6R2W3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
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