Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6P435 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6P435 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6P435 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6P435 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6P435 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms