Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC183Q5T5S1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms