Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM41BQ5BJD5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms