Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYTL3Q4VX76 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYTL3Q4VX76 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms