Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SP6Q3SY56 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SP6Q3SY56 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms