Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKIDA1Q1XH10 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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