Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Q1T7F1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Q1T7F1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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