Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPROQ16827 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPROQ16827 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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