Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FXNQ16595 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FXNQ16595 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FXNQ16595 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FXNQ16595 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FXNQ16595 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FXNQ16595 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FXNQ16595 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FXNQ16595 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FXNQ16595 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms