Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18Q15532 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18Q15532 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18Q15532 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SS18Q15532 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms