Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB35Q15286 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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