Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABEP1Q15276 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABEP1Q15276 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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