Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKD1Q15139 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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PRKD1Q15139 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRKD1Q15139 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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