Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK2Q15119 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK2Q15119 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms