Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFIXQ14938 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NFIXQ14938 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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