Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
EBI3Q14213 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBI3Q14213 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135 ms