Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBE4AQ14139 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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UBE4AQ14139 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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UBE4AQ14139 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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UBE4AQ14139 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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UBE4AQ14139 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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UBE4AQ14139 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
UBE4AQ14139 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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