Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1CQ13936 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1CQ13936 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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