Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EXOSC2Q13868 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms