Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKP1Q13835 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PKP1Q13835 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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