Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CACNA1SQ13698 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNA1SQ13698 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNA1SQ13698 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
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