Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4AQ13619 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4AQ13619 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms