Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRR1Q13601 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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