Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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C1orf61Q13536 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C1orf61Q13536 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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C1orf61Q13536 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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