Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXE3Q13461 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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