Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF1Q13351 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF1Q13351 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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