Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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SKP2Q13309 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP2Q13309 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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