Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLAMF1Q13291 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLAMF1Q13291 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms