Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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TRAF3Q13114 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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TRAF3Q13114 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF3Q13114 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
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TRAF3Q13114 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRAF3Q13114 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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