Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECH1Q13011 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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