Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMAN2Q12907 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms