Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM27E3Q08E93 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FAM27E3Q08E93 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms