Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPAQ06546 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms