Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NRG1Q02297 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NRG1Q02297 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms