Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CDK3Q00526 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms