Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC5Q00444 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms