Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CSNK2A1P68400 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSNK2A1P68400 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms