Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms