Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTC1P68032 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms