Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP1P63208 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP1P63208 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SKP1P63208 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SKP1P63208 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SKP1P63208 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms