Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ARF6P62330 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARF6P62330 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARF6P62330 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms