Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ERVK11-1P61568 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERVK11-1P61568 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms