Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVFRD-1P60508 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms