Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRP1P56182 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRP1P56182 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRP1P56182 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRP1P56182 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRP1P56182 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRP1P56182 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms