Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AFDNP55196 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AFDNP55196 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFDNP55196 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFDNP55196 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms