Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRISP1P54107 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CRISP1P54107 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms